怎样用初学者能看懂的语言介绍，如何设计引物？ - 知乎
网页3、外显子内含子（Exon/intron） 如果设计的引物是跨内含子和外显子的交界处，可在此处设置成为Primer must span an exon-exon junction。 外显子的匹配碱基数和内含子的长度等设置一般选择默认。
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hisat2建索引时不加--ss和--exon可以用来分析转录组吗？ - 知乎
网页师兄说那两个参数不重要。. 如果实在是想通过该方式生成索引，建议先将gff文件转换为gtf文件，然后就行了。. 编辑于 2021-01-19 00:02. emma. 学生. 可以的，加--ss和--exon是为了把外显子和内含子也索引出来. 发布于 2020-11-25 21:25. 我用hisat2-build 建索引，如果添加- …
哪位朋友做过850k甲基化芯片数据分析啊？ - 知乎
网页1st exon就是第一号外显子，gene body就是CDs区域，即coding region。 在基因示意图的下面，有CpG位点的分类。 分为CpG island（CpG岛），CpG岛上游2kb为N shore，上游2kb-4kb为N shelf，同理下游2kb为S shore，下游2kb-4kb为S shelf。
怎么从EXON id 知道是第几个外显子？ - 知乎
网页2017年10月26日 — 28号外显子。. 最左侧上面exon选项，搜索就能够看到ENSE00003793906属于Transcript: SCN1A-212 ENST00000636194.1转录本的28号外显子。. 发布于 2017-10-26 12:59. 怎么从exon id知道是第几个外显子？. 例如 基因id:ENSG00000144285 外显子id:ENSE00003793906 起始16598916….
lncRNA中的外显子序列为什么不翻译？成熟的mRNA链均是外显子 …
网页至于lncRNA的exon是根据大家默认的剪切位点来预测的，因为我们认为lncRNA也是完整的基因元件，也存在splice junction，所以按照mRNA的那一套来预测lncRNA的exon，但不代表这些exon可以编码蛋白。不过某些lncRNA确实可以编码一些小肽喔~
如何读懂基因组gff3注释文件? - 知乎
网页exon 2134409. enhancer 106998. biological_region 127871. mRNA 129738. CDS 1667936. pseudogene 16908. silencer 34197. transcriptional_cis_regulatory_region 2030. primary_transcript 1889. miRNA 2843. transcript 13574. meiotic_recombination_region 257. repeat_instability_region 55. nucleotide_motif 428. tandem_repeat 58. snoRNA 1190. …
分子生物学名词解释 - 知乎
网页多个exon经过可变剪接之后形成一个CDS exon转录后经过剪接，形成了一条成熟mRNA，这条成熟mRNA包括头部的5‘UTR、尾部的3’UTR和中间的CDS区域，而头尾的UTR分别是由其中的两个exon提供的（不一定是如图中所示的第一个exon和最后一个exon，应该也可能是由 …
检测到BRAF基因第15外显子点突变代表啥？ - 知乎
网页BRAF基因突变主要位于CR3激酶结构域的第11外显子及第15外显子，其中 BRAF最常见突变形式为第15外显子的第1,799位核苷酸上T突变为A，导致其编码的缬氨酸变为谷氨酸，即BRAF V600E突 变。. 这一突变可使BRAF蛋白持续激活，提高BRAF活性约500倍，激活后的BRAF成为能够不 ...
怎么调取人的所有外显子大小啊？ - 知乎
网页$ zcat gencode.v39.primary_assembly.annotation.gtf.gz | grep -v "^#" | awk '$3=="exon"{sum+=$5-$4+1}END{print sum}' 但这里的外显子是会存在重复的，因为注释文件里会有同一基因的多个转录本的注释，这些转录本之间很多外显子都是相同的（相同的基因组坐标），也可能会有不同基因 ...